In un saggio del 2006, il Cardinale Fernández ha criticato il divieto assoluto dell’uso della contraccezione nel matrimonio stabilito da Humanae Vitae, sostenendo che un’adesione rigorosa a questa norma potrebbe, in alcuni casi, andare contro la “carità fraterna” e l’amore coniugale. Ha suggerito che l’uso del preservativo potrebbe essere accettabile in determinate situazioni matrimoniali.